C中as early as the eighteenth century作为状语，表示（早在18世纪时）leaching是一种很完善的方法，而D中as early as the eighteenth century变成了定语修饰method，表示leaching是一种（18世纪完善建立的）方法。而后半句说，（直到25年前）工人才发现细菌在该过程中起作用。两个半句之间应该有对比转折的逻辑关系（用了but--应该是强烈转折和大对比的关系），因而从（）位置可以看出，C选项的对比更对称，即同样时间都作为状语而非定语。E中had been是过去完成时，容易让人以为和现在无关了，另外，同D（，well established)在句子中做定语，且是非限制性定语，使得well established 变成了一个不重要的成分，这样一来和后半句的对比就不再完整对称了。意思是leaching是一种方法，但是25年前工人才发现细菌起作用。---时间的一组对比就消失了。
But these studies have focused on villages with limited land that are tied to a market economy rather than on the relatively isolated, self-sufficient communities with ample land characteristic of rain-forest regions. 答案的one set of conditions , another set of conditions应该就是文中的Limited 和ample吧，说明两者的不同
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A中前后半句没有因果，解释等关系，所以不应该用独立主格。B中，过去时强调的是过去已经结束了，即和现在没有关系。那么过去出现的那么多动物（过去式说明他们应该在过去就灭绝了）到现在已经消失了99%。不合理。